哪给金刚鹦鹉做DNA?
楼上很多大佬都给了很专业的解答,那我就以一个普通爱好者且曾经养过金刚鹦鹉的经验来谈一下这个问题吧(虽然最后并没有成功)。 首先,你需要有可以采集到足够DNA的含量足够的样品。
在准备阶段中需要准备的设备包括:灭菌容器、低温保存箱、PCR仪、电击穿孔仪、凝胶成像系统——这是用于实验阶段;如果最终确认需要测序的话,还需要增加高通量测序仪器(如果有条件可以先使用16S或者ITS扩增仪先进行宏基因组测序)以及生物信息学分析平台。
当然,最重要的还是人——最好具有分子生物学实验室工作经验,熟悉各种分子生物学实验操作者优先;还需要有较强沟通能力与科技文献检索能力,能够独立设计并实施实验方案,分析数据并得出结论。 接下来进入正题。 首先要确定你的“它”是否能为实验提供足量的DNA。
以人类为例,人体表皮细胞(如指甲)或血液细胞等都可以作为样品来源,但不同个体间的基因型差异会使得出的结果产生偏差——对于动物而言,由于基因组较为完整,一般选择新鲜样本进行提取效果会更佳;而对于真菌来说,则需采用特殊方法进行处理后才能进行提取。
在提取完成后,根据实验设计的不同,还需进行后续的实验操作。以细菌为例,通常需要使用16S或ITS的扩增引物对目标序列进行扩增反应,然后通过凝胶电泳检测是否有特定的片段出现——有出现即表明该细菌具有你所需要的序列,没有则为纯合子失去杂交活性。若为真菌感染,则需要结合真菌培养及分子生物学鉴定方法进一步确认。
待实验完成后,将得到带有杂交信号的图谱以作为后续分析的参考依据。 最后,就是最为重要的数据分析环节了。这里涉及的内容较多,比如序列比对、同源性分析等等。
由于真菌的复杂性,有时可能单凭一种方法很难达到理想的效果,需要综合多种手段相结合才能最终完成目的。